En el marco de una colaboración internacional, representantes del Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas de la Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud (ANLIS) "Dr. Carlos G. Malbrán" han completado un entrenamiento en el Centro para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) en Atlanta, Georgia, Estados Unidos.

Este entrenamiento se enmarca dentro del Proyecto "Análisis Genómico y Epidemiológico de Enterobacterales Productores de Carbapenemasas en la Era Post Pandemia COVID-19 en Argentina: RECAPT-AR II", realizado por el Servicio de Antimicrobianos de la ANLIS, con el apoyo de los CDC de los Estados Unidos.

El objetivo principal del entrenamiento fue capacitar en protocolos de laboratorio avanzados y análisis bioinformáticos necesarios para implementar la tecnología de secuenciación de segunda generación con lecturas largas Oxford Nanopore.

En este sentido, el director de la ANLIS Malbrán, Pascual Fidelio, aseguró que “desde una perspectiva institucional, esta capacitación facilitará la adopción y el uso continuo de tecnologías avanzadas en el Servicio de Antimicrobianos y otros laboratorios del Instituto, fortaleciendo así las capacidades locales en la investigación y vigilancia microbiológica”.

Asimismo, Fidelio sostuvo que “este tipo de iniciativa promueve los lazos profesionales e institucionales entre la ANLIS Malbrán y los CDC, sentando las bases para futuras colaboraciones que mejoren la vigilancia, diagnóstico e investigación en salud pública a nivel local y regional”.

“Mirando hacia el futuro, la implementación de Oxford Nanopore en el Laboratorio Nacional de Referencia y en nuestra institución jugará un papel crucial en la respuesta a futuros escenarios epidemiológicos, como la investigación de mecanismos de resistencia emergentes y la identificación de nuevos patógenos, proporcionando respuestas rápidas y basadas en evidencia para contener estos riesgos”, agregó Fidelio.

Esta capacitación está destinada inicialmente a la secuenciación masiva de bacterias multirresistentes de origen clínico, proporcionando herramientas vitales para:

• Optimizar protocolos de trabajo de laboratorio húmedo y seco para la secuenciación de genomas bacterianos utilizando tecnología Oxford Nanopore.
• Establecer flujos de trabajo bioinformático personalizados y optimizados para el ensamblado y análisis exhaustivo de genomas bacterianos.
• Realizar análisis comparativos de elementos genéticos móviles, plásmidos y cromosomas frente a bases de datos genómicas públicas para identificar mecanismos de diseminación de resistencia bacteriana.

Los datos obtenidos permitirán comprender mejor los mecanismos genéticos involucrados en la diseminación de genes de resistencia, incluyendo aquellos que confieren resistencia a carbapenemas y otras familias de antibióticos. Además, se explorará la relación entre genes, especies bacterianas y clones, combinando estos datos con la metadata de proyectos de investigación del laboratorio.

En resumen, este proyecto representa un avance significativo para profundizar nuestra comprensión de la resistencia a los antimicrobianos en Argentina, esencial para el desarrollo de estrategias efectivas de prevención y control de infecciones en entornos hospitalarios y brotes epidémicos.