EL ICES se desarrolla en cuatro regionales San Rafael, Mendoza, Malargüe y Buenos Aires.
La regional ICES San Rafael se ubica en la Universidad Tecnológica Nacional Facultad Regional San Rafael y en esta se encuentra el LABORATORIO BIOAMBIENTAL.
La regional ICES Mendoza se localiza en el campus de la Universidad Nacional de Cuyo, donde se realizan tareas vinculadas al laboratorio bioambiental y tareas administrativas.
La regional ICES Malargüe está en el Planetario de la ciudad de Malargüe, Mendoza, y cuenta con instrumental para tareas bioambientales.
La regional Buenos Aires se ubica en el Centro Atómico Constituyentes de la CNEA. En esta se encuentran el Laboratorio de Desarrollo de Equipos, los Laboratorios de Ultrasonido, Emisión Acústica, Ruido Barkhausen y el Área de Ensayos de Estructuras. Además, es la sede de la Dirección Científica.