El Consorcio Proyecto PAIS -creado desde el Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación- divulgó el último reporte N°20 de vigilancia de variantes de SARS-CoV-2 que incluye a CABA y a las provincias de Buenos Aires, Córdoba, Entre Ríos, Mendoza, Neuquén, Río Negro, San Luis y Santa Fe.

Es muy importante destacar que se ha observado un aumento en la frecuencia de detección de las variantes 501Y.V1 (Reino Unido), 501Y.V3 (P.1, Manaos) y de la mutación S_L452Q en el AMBA en casos sin nexo epidemiológico con turismo al exterior durante las últimas semanas epidemiológicas (SE), alcanzando en la SE15 frecuencias del 27,1% (CABA) y del 12,8% (GBA) para la variante 501Y.V1 (Reino Unido); 31,3% (CABA) y del 31,9% (GBA) para la variante 501Y.V3 (P.1, Manaos); y del 33,3% (CABA) y del 48,9% (GBA) para la mutación L452Q compatible con linaje C.37.

Hasta el momento, no se detectó la combinación de mutaciones característica de la variante 501Y.V2 (Sudáfrica).

Asimismo, en la última semana epidemiológica analizada para la CABA y el GBA (mediados de abril) se observó que más del 90% de los virus SARS-CoV-2 que circularon en el AMBA poseen mutaciones en la proteína Spike que los diferencian de los virus que circularon en la primera ola.

Por otro lado, los análisis de muestreos en zonas específicas del país en periodos acotados mostraron una distribución heterogénea, con puntos de alta proporción de casos asociados con variantes de preocupación. Entre ellos, se destacaron el Gran La Plata, donde se observó la variante 501Y.V3 (Manaos) en el 70,7% de los casos analizados y Mar del Plata, con en el 42,9% de esta variante. En cambio, la ciudad de Tandil presentó un 62,5% de los casos asociados con variante 501Y.V1 (Reino Unido) -con un limitado número de muestras-.

Por su parte, en San Luis se detectó la variante 501Y.V3 (Manaos) en 46,6% de los casos provenientes de la ciudad de San Luis y localidades aledañas; y en Entre Ríos se observó también un predominio de esta variante, con un 58,3% de los casos, en individuos sin antecedente de viaje al exterior ni nexo epidemiológico con viajeros. En General Alvear, en Mendoza, la totalidad de los casos analizados corresponden a la variante 501Y.V3 (Manaos). Este brote está asociado al reingreso de un contingente turístico de residentes locales.

A su vez, en la provincia de Santa Fe se realizó la detección de dos casos de variante 501Y.V3 (Manaos) y un caso de variante 501Y.V1 (Reino Unido) en individuos sin antecedente de viaje al exterior o contacto estrecho con viajeros. En Córdoba se detectaron dos casos de la variante 501Y.V3 (P.1, Manaos) en individuos con antecedente de viaje y siete casos de la variante 501Y.V1 (Reino Unido), dos de ellos con antecedente de viaje a México y cinco adquiridos en la comunidad. Por último, en la provincia de Neuquén se detectó un caso de variante 501Y.V3 (Manaos) en un trabajador local temporal.

La vigilancia activa de las variantes de SARS-CoV-2 realizada sobre un total de 1848 muestras de la CABA y de las provincias de Buenos Aires, Córdoba, Neuquén, Santa Fe, Río Negro, Mendoza, San Luis y Entre Ríos (Reportes N°9 a 20) obtenidas entre el 26/10/2020 al 18/04/2021 permitió determinar la presencia de cuatro variantes de interés epidemiológico mundial en nuestro país: la variante 501Y.V1 (Reino Unido), la variante 501Y.V3 (linaje P.1, Manaos), la variante P.2 (Río de Janeiro) y la variante CAL.20C (California, linajes B.1.427 y B.1.429), y permitió la detección de un linaje de creciente importancia regional, el linaje C.37.

A su vez, hasta el momento, la mutación S_E484K en forma aislada se detectó en 129 casos -46 de ellos confirmados como linaje P.2- y las mutaciones S_L452R/Q/M en 322 casos -13 de ellos con la mutación L452R fueron confirmados como variante CAL.20C (California, 12 del linaje B.1.427 y una del linaje B.1.429) y 80 de ellos con la mutación L452Q fueron confirmados como linaje C.37-.

El Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación y el Ministerio de Salud trabajan coordinadamente en la vigilancia genómica de las nuevas variantes y los datos registrados se informan en el Sistema Integrado de Información Sanitaria Argentino (SISA).

Proyecto PAIS

Creado desde el Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación de la Nación, el Consorcio interinstitucional para la Secuenciación del genoma y estudios genómicos de SARS-CoV-2 (Proyecto PAIS) está conformado por grupos de investigación de diferentes instituciones con el objetivo de secuenciar el genoma y realizar demás estudios genómicos del SARS-CoV-2.
Coordinado por la Dra. Mariana Viegas del Laboratorio de Virología Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez, el equipo trabaja articulada y colaborativamente para realizar estudios genómicos de SARS-CoV-2 en nuestro país y aportar tanto al conocimiento local como a la base de datos global de circulación viral GISAID (Global Initiative on Sharing All Influenza Data). Entre sus objetivos se encuentran la secuenciación de los genomas circulantes de SARS-CoV-2 en distintas regiones de nuestro país, el análisis a gran escala de secuencias, ensamblado de genomas, análisis filogenéticos y filogeográficos, epidemiología y evolución molecular.